科学划定生态空间、生活空间、生产空间，严守主体功能区规划，推进国土空间规划编制，强化“三线一单”管控。

建立自然保护区（分区）17个，全州典型的生态系统、珍稀濒危野生动植物栖息地、自然景观优良的地区及生物多样性丰富的区域等得到全面有效保护。

以南部哀牢山生态屏障、北部生态屏障，金沙江干热河谷地带、红河干热河谷地带为依托，结合自然保护区、风景名胜区、森林公园、地质公园和饮用水源地保护区散状分布的“两屏两带多点”的生态安全格局体系更加牢固。

楚雄州先后组织开展了“古茶树资源调查”“兰科植物调查”“绿孔雀调查”“哀牢山西黑冠长臂猿调查”“哀牢山猫科动物调查”等专项调查工作，摸清生物多样性本底，并认真开展野生动植物保护科研监测工作。

据调查统计，全州目前拥有10个植被型（或植被型组），29个植被亚型共175个群系，全省三分之一以上的群系在楚雄州均有分布，拥有除热带雨林和荒漠（高山流石滩）之外的76个生态系统类型。

先后实施绿孔雀、滇南苏铁、西黑冠长臂猿等极小种群保护及栖息地恢复项目，加强珍稀、濒危物种的拯救。加强迁地保护体系建设。完善楚雄州珍稀濒危植物的种质资源和野生重要经济物种的保存和繁育体系。

加强湿地生物多样性保护，至2020年底，全州湿地面积共53.93万亩，受保护湿地面积40.06万亩，湿地保护率达74.23%。

楚雄州抓实农业外来有害生物普查、监测及检疫工作，先后对红火蚁、草地贪夜蛾、玉米褪绿斑驳病、柑橘黄龙病等农业外来有害生物进行普查并建立防控预案；对水葫芦、微甘菊、紫茎泽兰、福寿螺等外来物种开展调查、监测和防控。

截至目前，楚雄州共有外来入侵植物10种、动物12种，其中以紫茎泽兰、空心莲子草、凤眼莲和草地贪夜蛾为主。

“十三五”以来，楚雄州扎实做好各类重大林业有害生物防控工作，各项指标均在云南省规定的控制指标以内。